ANDAS Data Analyzer

Das AmoyDx^® NGS Data Analysis System (ANDAS) besteht aus einer lokalen Workstation und der darauf vorinstallierten, CE/IVD-klassifizierten NGS-Analyse-Software. Die Workstation basiert auf einem Dell PowerEdge Server, der wahlweise direkt mit einem Illumina Sequenzierer verbunden oder in ein bereits vorhandenes lokales Netzwerk integriert werden kann. Die Datenanalyse mit der ANDAS Analyse-Software erfolgt über eine benutzerfreundliche, browserbasierte Oberfläche. Die Software enthält einzelne Module für die Auswertung der verschiedenen AmoyDx^® NGS-Panels, in denen mehrere Datenbanken zur Benennung und Bewertung von Varianten integriert sind. Eine Internetverbindung des Servers ist nicht nötig, da die Datenbanken durch regelmäßige Updates der Module aktualisiert werden. Die Analyse Ihrer Sequenzdaten ist damit schnell, einfach und sicher durchführbar. Die Ergebnisse sind in Form einer Excelliste exportierbar, die neben den Qualitätsparametern der Sequenzierdaten auch eine Bewertung der Varianten sowie Links zu den dazugehörigen Datenbanken (z.B. COSMIC, ClinVar) enthält. Zur Beurteilung einzelner Varianten in IGV können zusätzlich die BAM/BAI- und VCF-Dateien exportiert werden. 

• CE/IVD-klassifiziert

• In wenigen Schritten von den Rohdaten zur tumorgenetischen Analyse

• Anzeige von wichtigen Qualitätsparametern wie Q30, Sequenziertiefe oder Abdeckung der Zielregionen für jede Probe

• Anzeige der Varianten-Klassifikation aus verschiedenen Datenbanken, z. B. ClinVar, COSMIC und BRCA Exchange

• Regelmäßige Updates der verwendeten Datenbanken

• Lokale Workstation als sichere stand-alone Lösung für die Datenverarbeitung

Software

ANDAS Analyse-Software mit Modulen für verschiedene Kits, Darstellung der Qualitätsparameter für Sequenzier- und Analyseergebnisse, Datenexport modulspezifisch in verschiedenen Formaten wie BAM/BAI, VCF und Excel möglich.